{"id":2507,"date":"2011-08-24T15:50:20","date_gmt":"2011-08-24T12:50:20","guid":{"rendered":"http:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/\/?p=2507"},"modified":"2011-08-24T15:50:20","modified_gmt":"2011-08-24T12:50:20","slug":"biyoinformatik","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/biyoinformatik\/","title":{"rendered":"Biyoinformatik"},"content":{"rendered":"<p>Biyoinformatik, biyolojik bilgilerin yarat\u0131lmas\u0131 ve saklanmas\u0131 i\u00e7in veritabanlar\u0131n\u0131n olu\u015fturulmas\u0131d\u0131r.Bu konudaki \u00e7al\u0131\u015fmalar\u0131n \u00e7o\u011fu biyolojik verilerin analizi ile ilgilidir. Artan say\u0131daki projelerde biyolojik bilgilerin organizasyonu gerekmektedir. Bu alanda olu\u015fturulan veritabanlar\u0131n\u0131n b\u00fcy\u00fck bir k\u0131sm\u0131n\u0131 n\u00fckleik asitler olu\u015fturmaktad\u0131r. <\/p>\n<p>Milyonlarca n\u00fckleotidin depolanmas\u0131 ve organizasyonu i\u00e7in veritabanlar\u0131n\u0131n olu\u015fturulmas\u0131, ara\u015ft\u0131r\u0131c\u0131lar\u0131n bu bilgilere ula\u015fabilmeleri ve yeni veriler girebilmeleri i\u00e7in ilk a\u015famad\u0131r. Biyoinformatik\u2019te n\u00fckleotid dizi bilgilerinin organizasyonu ve depolanmas\u0131 g\u00f6revini \u00fcstlenmi\u015f \u00fc\u00e7 kurulu\u015f vard\u0131r. Genbankas\u0131 (GenBank), Avrupa Molek\u00fcler Biyoloji Laboratuvar\u0131 (EMBL) ve DNA Japonya veritaban\u0131d\u0131r (DDBJ). Bu \u00fc\u00e7 kurulu\u015f, ara\u015ft\u0131r\u0131c\u0131lar\u0131n yararlanmas\u0131na a\u00e7\u0131k, n\u00fckleotid dizi bilgilerinin toplanmas\u0131 ve yay\u0131lmas\u0131nda i\u015fbirli\u011fi i\u00e7inde \u00e7al\u0131\u015fmaktad\u0131r. Gen Bankas\u0131 ABD\u2019de Maryland, Bethesda\u2019da, Avrupa Molek\u00fcler Biyoloji Laboratuvar\u0131, \u0130ngiltere\u2019deki Hinxton\u2019da ve DNA Japonya veritaban\u0131 ise Japonya\u2019da Mishima\u2019da yeni dizi bilgilerinin al\u0131\u015fveri\u015finde,\u0130nternet \u00fczerinde g\u00fcnl\u00fck olarak e-mail, ortak kullan\u0131lan ftp ve www \u00fczerinden hizmet sunmaktad\u0131rlar. Protein dizi verileri ile ilgili ba\u015fl\u0131ca hizmet sa\u011flay\u0131c\u0131lar ise GenBank, EMBL, PIR International ve Swiss-Prot\u2019tur. NIH\u2019in National Center for Biotechnology Information merkezi, biyoinformatik gereci sunan ba\u015fl\u0131ca web sayfalar\u0131ndan biridir. Ve g\u00fcnde 3 milyon ara\u015ft\u0131rmac\u0131 taraf\u0131ndan ziyaret edilmektedir. <\/p>\n<p>Veritabanlar\u0131ndaki baz\u0131 sorunlar; vekt\u00f6riyel dizilerle kirlilik, bir gene ait dizi par\u00e7a\u00e7\u0131klar\u0131n\u0131n veritaban\u0131na birden \u00e7ok kez girilmesi ile ortaya \u00e7\u0131kan kalabal\u0131k, ayn\u0131 gene ait birden fazla EST (Ekspressed Sequence Tag) i\u00e7eren EST veritabanlar\u0131n\u0131n olmas\u0131 gibi durumlard\u0131r. Bu durumlar; genom projelerinin ileri a\u015famalar\u0131n\u0131 olu\u015fturan UNIGENE, VecScreen gibi projelerle ortadan kald\u0131r\u0131lmaya \u00e7al\u0131\u015f\u0131lmaktad\u0131r. <\/p>\n<p>Biyoinformati\u011fin ikinci \u00f6zelli\u011fi; saklanan biyolojik bilgilerin analizidir. Analiz kapsam\u0131na giren konular;<br \/>\n\u00c7e\u015fitli organizmalardaki DNA dizilerinin hangi genlere ait oldu\u011funun belirlenmesi<br \/>\nYeni ke\u015ffedilen proteinlerin ve RNA dizilerinin yap\u0131 i\u015flev ili\u015fkilerinin belirlenebilmesi i\u00e7in y\u00f6ntem geli\u015ftirilmesi<br \/>\nProtein dizilerinin ilgili gen ailelerine k\u00fcmelernmesi ve protein modellerinin geli\u015ftirilmesi<br \/>\nBenzer proteinlerin s\u0131ralanarak evrimsel ortaya \u00e7\u0131karacak filogenetik ailelerin olu\u015fturulmas\u0131d\u0131r.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Biyoinformatik, biyolojik bilgilerin yarat\u0131lmas\u0131 ve saklanmas\u0131 i\u00e7in veritabanlar\u0131n\u0131n olu\u015fturulmas\u0131d\u0131r.Bu konudaki \u00e7al\u0131\u015fmalar\u0131n \u00e7o\u011fu biyolojik verilerin analizi ile ilgilidir. Artan say\u0131daki projelerde biyolojik bilgilerin organizasyonu gerekmektedir. Bu alanda olu\u015fturulan veritabanlar\u0131n\u0131n b\u00fcy\u00fck bir k\u0131sm\u0131n\u0131 n\u00fckleik asitler olu\u015fturmaktad\u0131r. Milyonlarca n\u00fckleotidin depolanmas\u0131 ve organizasyonu i\u00e7in veritabanlar\u0131n\u0131n olu\u015fturulmas\u0131, ara\u015ft\u0131r\u0131c\u0131lar\u0131n bu bilgilere ula\u015fabilmeleri ve yeni veriler girebilmeleri i\u00e7in ilk a\u015famad\u0131r. Biyoinformatik\u2019te n\u00fckleotid &hellip;<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1407,1403],"tags":[6194,5967,2303],"class_list":["post-2507","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-fen-ve-teknoloji-odevleri","category-odevler","tag-genom","tag-nukleotid","tag-protein"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2507","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2507"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2507\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2507"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2507"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.islamidavet.com\/kutuphane\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2507"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}