El Aksa Şehitleri, grubun Filistin genelindeki tabur ve bölüklerine komuta edecek birleşik bir askeri konsey kurulduğunu duyurdu; Bundan önce Kataib Şehadetu’l-Aksa’nın tek bir komutanlığı yoktu ve komutası yerel liderlerin sorumluluğundaydı.